Nat Biotechnol：研究不能重复？可能会是HeLa细胞系“变”了

HeLa线粒本体已经在全世界的许多试验中所室培训了近70年，并且长期以来被显然是无限自给自足的不坏的有所不同线粒本体。然而，2年底18日撰写在《Nature Biotechnology》杂志上的一项新深入研究暗示，线粒本体在有所不同试验中所室相互间共存很大关联，这引发了对线粒本体则有深入研究重复用于性的质疑。“我很高兴看不到这项深入研究，但在比如说上我并不令人惊讶，”斯隆迪恩琳前列腺癌中所心的分子生物学家Prasad Jallepalli说道，他没有作准备这项深入研究。这并不是HeLa线粒本体则有自问世以来第一次出现多样化的报道：长期以来，其他深入研究小组也暗示了HeLa线粒本体坏异本体相互间在基因序列和RNA表达的相比较关联。这项同类型深入研究首次全面分析了各种HeLa坏异本体的遗传坏异（有所不同批次的HeLa线粒本体则有生活在全世界的各个试验中所室），并且首次暗示遗传异质性导致了酶表达和表型的坏化。HeLa线粒本体“坏了”？在这项深入研究中所，深入研究其他部门从6个国内的13个试验中所室收集了14份HeLa样本，并在有所不同的试验中所室情况下下完成培训。他们首先量化了基因拷贝数坏异，说明了了它们基因组相互间的相比较关联。结果发现，HeLa坏异本体相互间，特别是CCL2和Kyoto坏异本体相互间共存着巨大的异质性。全面的得出结论，许多这些遗传关联转化为mRNA产生的坏化，并且在较小总体上转化为酶丰度的坏化。深入研究其他部门简报说道，HeLa CCL2和Kyoto线粒本体则有的转录组和酶组谱彼此相互间的关联，就像来自两种有所不同类型组织的癌线粒本体则有相互间的关联一样。HeLa坏异本体在培训步骤中所湿润愈来愈快也有所不同，一些线粒本体群集需要17.5时长才能少于，而另一些线粒本体在有所不同的培训情况下下需要话费多达32时长。它们对沙门氏菌受到感染的催化也有所有所不同：与其他两种坏本体相比，一种坏本体对受到感染的敏感性较低，深入研究其他部门将其归因于低水平的酶复合物，这种酶复合物在细菌进入宿主线粒本体中所起抑制作用。在一项单独的试验中所中所，深入研究小组通过培训线粒本体则有三个年底，来观察HeLa坏异本体的表征是否不会随着星期发生坏化。深入研究其他部门记录了中所期线粒本体和晚期线粒本体相互间表征关联至少6%。苏黎世联邦理工学院分子则有统生物学深入研究所的Ruedi Aebersell教授是该深入研究的合着者，他说道，“即使在同一个试验中所室里，这些线粒本体的关联和坏化愈来愈快也是比较惊人的。”他估算，如果一个深入研究生在项目开始时用HeLa线粒本体则有做到了一个试验中所，并在六个年底后被建议重复用于这个试验中所，他们不会赢取有所不同的结果。关于深入研究中所的“可脱氧核糖核酸性恐慌”的争辩大多数集中所在试验中所设计、生物信息学方面的缺陷，以及作为主要驱动因素的受污染或黏贴确标签的线粒本体则有。但是Aebersell显然，HeLa线粒本体则有和癌线粒本体则有的生物学关联可能是关键。为什么不会“坏”？斯坦福大学的线粒本体生物学家Tim Stearns显然有几个可能的原因可以推论为什么线粒本体则有在长星期培训下不会发生坏化。首先，HeLa线粒本体是据信基因组不稳定的癌线粒本体，因此很可能随星期随机突坏。此外，它们还不会在试验中所室中所受到各种湿润情况下的因素，这不会促使线粒本体进化出独特的特征。例如，他说道，哺乳动物线粒本体的培训包括将其培训到充满一个培训皿为止，从培训皿中所抽取一部分线粒本体，然后将它们放在另一个培训皿中所湿润，这一步骤称为分裂。“每个人做到这件事情的方式也都有点有所不同，”他说道道。同类型这些发现，对于人类培训线粒本体的深入研究结果的推论和重现性有一定的意义。Aebersell和他的同事情在论文中所明确提出了几个具本体的解决方案。首先，深入研究其他部门应当用于癌线粒本体则有的中所期传代，并确保安全在同一线粒本体则有的有所不同样本中所重复用于同一线粒本体则有的试验中所。愈来愈重要的是，生物学家应当吻合地简报他们在formula_的深入研究中所用于的线粒本体则有坏异本体。