Cell Res：北京序列所合作揭示 RNA 甲基化调控 R -loop 形成及转录终止

R-loop 是一种由 RNA：DNA 杂合末端和单末端 DNA 组成的特殊大分子结构上，在原核和真核生物的遗传物质中分布广泛且比如说。R-loop 在很多关键的生物学过程中起到重要功用，包括核仁结构上、激活诱导、DNA 破损修复以及遗传物质平稳性等，但其如何被精确诱导的机制由此可知不吻合。m6A 结构上作为信使 RNA 上丰度最高的结构上类型，广泛参与两栖类的发育、免疫反应、干细胞更新、脂肪分化、以及生成和转移等生命过程。然而，目前由此可知不吻合 m6A 是否能作为 R -loop 中 RNA 溶剂的本源外观上来诱导 R -loop 水平，进而起到各种生物学功用。清华大学北京遗传物质研究所杨运桂、任捷与清华大学生科院孙前文制作组合作伙伴研究，断定 m6A 能平稳 R-loop 的构成，进而诱导基因激活的有效中止。这一科研成果以《m6A promotes R-loop formation to facilitate transcription termination》为题于 10 月 12 日在线发表于《细胞研究》（Cell Research）周报。研究制作组首先通过斑点分子杂交和免疫反应荧光技术，断定敲低 m6A 以次基转移酶 METTL3 显着减小 R -loop 水平，且该诱导作用依赖于 METTL3 以次基转移酶活性。随后，制作组领导者运用高效液相色谱联合质谱技术，断定相较于线粒体相结合的 RNA（caRNA），R-loop 的 RNA 溶剂有更加富含的 m6A 结构上。大幅度运用基于单末端 DNA 建库的 DNA：RNA 杂合末端免疫反应共沉淀生物技术测序技术（ssDRIP-seq），断定下调的 R -loop 主要富含在激活中止区域，R-loop 变化程度与 m6A 的西南方和结构上水平相关。为了探求 m6A 对 R -loop 诱导的生物学功用，研究制作组绘制了 RNA PCR激活肽末端的成像图谱，并在 MYC、ACTIN 基因上进行多种激活活性检测，断定 m6A 推动 R -loop 构成是激活中止阶段的的有，可以防止 RNA PCR的激活通读。最终，制作组领导者构建了针对激活通读的报告基因系统，通过 m6A 结构上肽末端的性状大幅度声称 m6A 对于 R -loop 构成及激活中止的巨大作用。该研究断定了 m6A 以次基化结构上的共激活诱导功用，概述了 RNA 以次基化结构上对核仁结构上的受到影响，以及 R-loop 结构上中的 RNA 溶剂被结构上后对其自身稳态的诱导机制，说明了了 m6A 通过平稳 R-loop 而推动激活正常中止的震荡，为大幅度研究 m6A 与 R-loop 的诱导机制和都可生物学功用获取了基本的技术和理论支架。该研究得到了中国科学院战略性先导科技专项、发达国家自然科学以及发达国家重点研发计划等基金拨款。原始引自：Xin Yang， Qian-Lan Liu， Wei Xu， et al. m6A promotes R-loop formation to facilitate transcription termination. Cell Research (2019).