Cell | 染色质激活或抑制状态立即了核小体分离的差异性

2022-01-24 00:18:10 来源:
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细胞核在结构上通过倡导或减缓该在结构上的RNA可以控制基因基因组组的功能和细胞名义认定。这些细胞核在结构上中的存在特定的脱氧核糖核酸翻译后剪裁(posttranslational modifications,PTMs),它们与特定RNA稳定状态涉及,并可倡导选择性染色体在结构上的形成,阻碍基因基因组的传达。为了在介导时依然保持基因基因组传达程序的完整性,同意细胞核在结构上的分子特征也需要在子代细胞中的建立。建立各不互为同型式号细胞核稳定状态的不可或缺同意因素是脱氧核糖核酸PTMs,主要存在于脱氧核糖核酸H3和H4的翅膀上。因此,在介导的过程中的,除了DNA遗传物质,特异性核小体也需要整修,并平均分配到子代细胞中的。确实,学术研究挖掘出特异性的当今脱氧核糖核酸(比如遗传物质依赖的脱氧核糖核酸)会在遗传物质短柄后短时间新的零部件。各不互为同的学术研究组挖掘出H3K9me3和H3K27me2/3可通过生殖细胞基因突变。然而,这两个脱氧核糖核酸剪裁都是与选择性细胞核在结构上涉及。那么,特异性中的的核小体,以及它们载有的脱氧核糖核酸PTMs是否都能基因突变到子代细胞有所各不互为同的基因基因组一层楼上呢?来自纽约大学兰戈恩医学中的心的Danny Reinberg教授课题组在Cell发表学术研究Active and Repressed Chromatin Domains Exhibit Distinct Nucleosome Segregation during DNA Replication,该学术研究挖掘出在DNA遗传物质时,介导与备受减缓细胞核周围的核小体分离是各不互为同的。备受减缓细胞核在结构上中的的核小体会被安置在子代细胞有所各不互为同的基因基因组周围,而介导型号细胞核在结构上中的的核小体的平均分配则是弥散和随机的。为学术研究核小体的分离原因,学术学者在候选基因基因组一层楼不可逆的标示脱氧核糖核酸H3.1和H3.2,以小鼠胎盘干细胞中的核小体在介导时的改变。非常简单来说,该新方法通过邻近蛋白标示技术,透过CRISPR为特定基因基因组一层楼的H3.1和H3.2带上酪氨酸标示,经ChIP-qPCR检验该酪氨酸标示在细胞内G1期和S期的丰度,以反应核小体的分离原因。若该基因座H3.1和H3.2上的酪氨酸标示在一次介导后下降一半,说明该核小体被安置在了两个子代细胞的有所各不互为同基因基因组一层楼上;若该酪氨酸剪裁很快消失,说明子代细胞并未基因突变该基因基因组一层楼的核小体。学术学者首先检验了在胎盘干细胞中的无声传达的Hoxc6, Ebf1, Meis2基因基因组的核小体分离原因。这些基因基因组一层楼的核小体酪氨酸水平随介导日趋减半,这提示备受减缓的基因基因组一层楼的核小体会被安置在子代细胞的有所各不互为同位置。这与前人挖掘出的H3K9me3和H3K27me2/3可通过生殖细胞基因突变的现象互为印证。那么,介导型号细胞核周围的核小体又是如何分离的呢?学术学者检验了在胎盘干细胞中的被介导传达的Ccna2, Nanog和Pou5f1基因基因组,挖掘出该基因基因组一层楼的酪氨酸标示在介导后呈弥散稳定状态,丰度很低,这提示对于介导型号细胞核周围来说,特异性核小体没有粗略的平均分配到子代细胞反之亦然的基因基因组一层楼,而是随机平均分配的。更像是的是,在诱导胎盘干细胞分化时,Hoxc6基因基因组由减缓转用介导,它的核小体平均分配模式也由粗略的同基因座平均分配改为随机平均分配。这说明特异性核小体的局部平均分配,可以反映该细胞核周围的活性稳定状态。总的来说,该学术研究通过CRISPR正向的脱氧核糖核酸酪氨酸标示系统对,学术研究了核小体在介导过程中的的有理数,并挖掘出介导与备受减缓的细胞核周围的核小体有理数的各不互为同。除此以外的是,在细胞内的S前所的,备受减缓的细胞核周围的遗传物质要晚于介导型号细胞核周围。这个时间段差异也导致常细胞核的遗传物质互为对速度大于异细胞核。异细胞核互为对较慢的遗传物质速度可能确保了核小体的粗略平均分配,而常细胞核中的的PTMs则由反之亦然的主调节因子(master regulators)直接识别反之亦然DNA基因组,并招募PTMs酶新的建立。更早出处:Escobar TM1, Oksuz O1, Salda?a-Meyer R1, et al.Active and Repressed Chromatin Domains Exhibit Distinct Nucleosome Segregation during DNA Replication.Cell. 2019 Oct 31;179(4):953-963.e11. doi: 10.1016/j.cell.2019.10.009.
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